
拓海先生、最近『形態(モルフォロジー)と空間オミクスの組合せ』という分野で面白い論文が出たと聞きました。現場で使える話になるか、ぜひ教えてください。

素晴らしい着眼点ですね!話題の論文は、画像で得られる組織の“見た目”情報を、遺伝子発現などの分子データとどう組み合わせるかを整理したレビューです。大丈夫、一緒に要点を押さえていけるんですよ。

言葉は難しいのですが、要は写真の情報で遺伝子の様子がわかるのか、それとも別に測らないとダメなのか、という話ですか?投資対効果の観点で知りたいのです。

その疑問は核心を突いていますよ。簡単に言うと、画像(形態)には遺伝子発現と強く対応する特徴が含まれる場合と、補完情報として使ったほうが良い場合があるんです。ここを整理すると、投資判断がしやすくなるんですよ。

これって要するに形態から遺伝子発現を予測できるということ?それとも、両方を合わせるともっと良くなるということですか?

良い質問です。要点は三つです。第一に、画像だけで遺伝子を『翻訳(translation)』して予測できるケースがある。第二に、画像と分子データを『統合(integration)』して補完し合うことで全体像がよく分かるケースがある。第三に、画像が役に立たないノイズでしかない場合もあり、ここを見極めるのが肝要です。

それぞれに具体例はありますか。経営判断で言うと、どちらに投資すれば短期で効果が出ますか。

短期効果なら『翻訳』が分かりやすいです。安価な画像だけで特定の遺伝子マーカーを推定できれば、検査コストを下げられます。中長期では『統合』が投資価値を生み、画像で見えない現象を分子データが補うことで新しい洞察が得られます。

現場では画像のどんな特徴を見ればいいのでしょうか。現場の担当者にも伝えられる言い方がほしいのですが。

良い伝え方があります。まず『関連性(relevance)』、つまりその画像の特徴が遺伝子発現とどれだけ結びつくかを見る。次に『共有情報(shared information)』、画像と分子がどれだけ同じことを言っているかを評価する。最後にそれが業務にどう貢献するかで導入の優先度を決めると説明してください。

ふむ、現場目線で言うと『これは使える』『これは補助的』『これは捨てる』という三段階に分ける、ということですね。これなら現場でも判断しやすいです。

その通りです。要点を三つにまとめます。第一、画像は安価で得られるため試験的導入のハードルが低い。第二、画像単独で有用な場合は即効性がある。第三、統合が必要な場合は長期的な投資対効果を見込む必要がある。大丈夫、一緒に実行計画を作れば必ずできますよ。

ありがとうございます。では短くまとめますと、画像で直接使える特徴があれば短期で効果、なければ分子データと統合して中長期で効果を狙う、という理解で合っていますか。自分の言葉で言うと、画像はまず試す価値があるツールで、その後必要に応じて分子データを組み合わせる、と説明します。


