PharmacoNet:深層薬効基(Pharmacophore)モデリングによる大規模バーチャルスクリーニングの高速化 (PharmacoNet: Accelerating Large-Scale Virtual Screening by Deep Pharmacophore Modeling)

田中専務

拓海先生、最近部下から『薬の候補を大量に絞るAI』の話を聞いたんですけど、正直よく分かりません。要するにうちの業務に関係ある話なんでしょうか。

AIメンター拓海

素晴らしい着眼点ですね!大丈夫、簡単に整理しますよ。今回の研究は『PharmacoNet』という仕組みで、要するに大量の化合物候補から短時間で有望なものを残す手法なんです。

田中専務

化合物、候補、って聞いただけで頭が痛いです。うちがものづくりで使うとなると、投資対効果はどう判断すればいいですか。

AIメンター拓海

大丈夫、一緒にやれば必ずできますよ。要点は三つです。第一に処理速度、第二に汎用性、第三に候補の保持率です。PharmacoNetはこれらを高い水準で実現できる可能性がありますよ。

田中専務

これって要するに『速く絞れて、ちゃんと良いものを残せるふるい』ということ?投資はそのふるいで上手く候補を残せるかで判断すれば良いですか。

AIメンター拓海

まさにその通りですよ。言い換えれば、『短時間で多くの候補を吟味して、次に詳しく調べるべき候補だけ残す自動化のふるい』です。業務的には、現場作業を減らして効率を上げる投資判断に直結します。

田中専務

聞くと良さそうですが、実装すると現場の人間が混乱しそうです。現場で使えるレベルに落とし込めますか。

AIメンター拓海

大丈夫、丁寧にやれば現場導入は可能です。まずはプロトコルを簡素化して、エンジニアがブラックボックスで操作するのではなく、現場が判断できる出力を出す仕組みにします。要は見える化と操作の簡便化です。

田中専務

具体的にはどのくらい速いんですか。うちのIT担当が『桁違いに速い』と言っていましたが、信頼できる数字が欲しいです。

AIメンター拓海

この研究では、百万件の候補化合物の事前スクリーニングを11分で処理した実績が報告されています。計算資源は16コアCPUでの測定ですから、クラウドで少し拡張すれば十分実用的です。

田中専務

11分で百万件。聞いただけで驚きます。で、誤って有望な候補を落とすリスクはどの程度ですか。

AIメンター拓海

ここが重要な点です。PharmacoNetは単に速いだけでなく、事前フィルターで有望候補を高確率で保持する設計になっていると報告されています。つまり誤落ちは低めに抑えられており、次段階での詳細解析に十分な候補が残るのです。

田中専務

これなら投資判断もつけやすそうですね。要するに、スピードと精度のバランスをとってコストを下げる仕組み、という理解で合ってますか。私の言葉でまとめるとそうなります。

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