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表現と最適化の出会い:システム薬理学におけるPINNsとPIKANsのトレーニング

(Representation Meets Optimization: Training PINNs and PIKANs for Gray-Box Discovery in Systems Pharmacology)

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田中専務

拓海先生、最近部下から『物理情報ニューラルネットワークって知ってますか』と急に言われましてね。正直、何ができるのかピンと来ないのですが、投資に見合うものでしょうか。

AIメンター拓海

素晴らしい着眼点ですね!大丈夫、一緒に整理すれば必ず分かりますよ。要点は3つです。1つ目はどんな問題に向くか、2つ目は導入時の注意点、3つ目は現場でのROIの見方です。

田中専務

ROIの話は聞きたいです。現場はデータが散在しており、完全なモデルを作る余裕はありません。こういう場合に向いているのですか。

AIメンター拓海

まさにその通りです。今回扱う技術はPhysics-Informed Neural Networks (PINNs) ― 物理情報ニューラルネットワークと、Physics-Informed Kolmogorov–Arnold Networks (PIKANs) ― 物理情報コルモゴロフ・アーノルド・ネットワークです。どちらも部分的に分かっている物理法則と観測データを組み合わせて“灰色箱(gray-box)”モデルを見つける用途に向きますよ。

田中専務

これって要するに、現場で測れない部分をAIに埋めさせるようなもの、ということですか。

AIメンター拓海

要するにその通りです。よく気づかれました。私の説明は3点です。一、既知の物理法則を守らせながら学習する。二、観測の欠落やノイズに強い設計が可能である。三、表現力の違い(MLPベースのPINNsと関数分解型のPIKANs)が学習の安定性や速度に影響する、です。

田中専務

表現力の違いというのは投資対効果に直結しますか。学習が遅かったり不安定だと現場が辛いのです。

AIメンター拓海

良い視点です。結論から言うと、学習の速さと精度は表現モデルと最適化手法(optimizer)の組合せに大きく依存します。論文は学習率や最適化アルゴリズム、数値精度(single vs double)やウォームアップの有無が結果を左右すると示しています。経営的には初期コストを抑えつつ安定性を取るか、計算資源を投じて高速化を狙うかの二択になりますよ。

田中専務

具体的に、うちのような製造業の現場に導入する場合、最初に何を見れば良いですか。データ量は限られています。

AIメンター拓海

優先順位は3つです。一、既知の方程式や保存則など“入れられる物理知識”を明確にする。二、観測できる変数とその頻度、ノイズ特性を把握する。三、計算資源と許容時間を決める。これを基にPINNsかPIKANsか、そしてどの最適化手法を使うかを決めます。どれも現場データの性質に依存しますよ。

田中専務

最後に一つ。専門用語を会議で簡潔に説明する方法を教えてください。時間が短いので端的に伝えたいのです。

AIメンター拓海

素晴らしい着眼点ですね!短いフレーズでいくつか提案します。1、『部分的に分かっている物理則とデータを組み合わせて、見えない部分を推定する手法です』。2、『表現方法と最適化方法で学習の安定性と速度が変わります』。3、『まずは小さな灰色箱(gray-box)課題で試し、ROIを評価しましょう』。この3点を押さえれば会議は十分です。

田中専務

分かりました。では私の理解を一言で言うと、『既知の物理を守らせつつ、データの足りない部分をニューラルモデルで埋め、最適化の組合せで現場の実用性を高める技術』、ということでよろしいですか。言い回しに自信がないので確認したいです。

AIメンター拓海

完璧です!その表現で十分に通じますよ。大丈夫、一緒にやれば必ずできますよ。


1.概要と位置づけ

結論を先に述べる。本研究はPhysics-Informed Neural Networks (PINNs) とPhysics-Informed Kolmogorov–Arnold Networks (PIKANs) を比較し、灰色箱(gray-box)としての系同定における表現と最適化の相互作用を明確にした点で従来を大きく前進させた。特に、PIKAN系の新しいtanh-cPIKANという表現が、Chebyshev多項式による一変数関数のパラメータ化と追加の非線形性を組み合わせることで学習の安定性と速度を改善する可能性を示したのが本論文の中核である。研究は薬物動態(pharmacokinetics)と化学療法薬反応モデルの二事例を用い、実務に近いデータ不足・非一意解の条件下における最適化手法の振る舞いまで踏み込んだ。経営判断の視点では、単にモデルの精度を見るだけでなく、表現選択と最適化戦略が計算コストと現場実用性に直結する点を示したことが最大の意義である。

2.先行研究との差別化ポイント

先行研究は主にPINNsを中心に、物理規約を損失関数に組み込むアプローチの有効性を示してきたが、表現形式と最適化の詳細な相互作用については未解明のままであった。差別化された点は二つある。第一に、PIKANsというKolmogorov–Arnold Networks (KAN) に基づく表現が、特定の問題でMLP(多層パーセプトロン)ベースのPINNsよりも学習効率に優れる条件を実験的に示したこと。第二に、最適化手法の違い(1次・2次・ハイブリッド)や学習率スケジューリング、数値精度(single vs double)といった実務的なハイパーパラメータが、非一意解やデータ希薄条件で結果を大きく左右することを系統的に評価した点である。これにより単なる理論性能の比較に終わらず、現場での選択基準を提供した点が従来との決定的な違いである。

3.中核となる技術的要素

本研究が扱う主要な技術要素は三つある。第一にPhysics-Informed Neural Networks (PINNs) ― 物理情報ニューラルネットワークは、既知の微分方程式や保存則を損失関数に組み込み、データから未知パラメータや隠れ状態を推定する手法である。第二にPhysics-Informed Kolmogorov–Arnold Networks (PIKANs) ― 物理情報コルモゴロフ・アーノルド・ネットワークは、Kolmogorov–Arnold表現を用い、関数を一変数関数と線形射影の組合せで分解することで表現効率を高めたものである。第三に最適化の実装面である。具体的にはOptaxライブラリを用いて多数の最適化アルゴリズムをベンチマークし、学習率、ウォームアップ、勾配の取り扱い、そして計算の数値精度がモデルの収束性や最終精度に及ぼす影響を詳細に解析している。ビジネスの比喩で言えば、モデルが『どのように情報を持たせるか』が表現、そして『どのように学ばせるか』が最適化であり、両者の組合せがプロジェクトの費用対効果に直結する。

4.有効性の検証方法と成果

検証は二つの代表的なシステム薬理学ケースで行われた。一つは薬物動態(pharmacokinetics)モデルであり、もう一つは化学療法薬の薬物応答モデルである。いずれも前向き問題を数値的に解き、その軌跡から観測をサンプリングして学習データを生成する実務に近い設定を採った。成果として、tanh-cPIKANが特定の設定で学習速度と最終精度の両面で有利に働く場面を示した一方で、PINNsがデータと物理情報のバランスが取れたケースで堅牢に動く場面も確認された。さらに最適化面では、2次法が局所的に優れるがウォームアップや初期学習率の調整が不可欠であること、1次法は安定性に優れるが収束が遅くなることが明確になった。これらの知見は現場でのプロトタイピング戦略にそのまま応用可能である。

5.研究を巡る議論と課題

議論点は主に三つある。一つは数値精度と実行速度のトレードオフであり、特にJAX等の高速実装は計算効率を高める一方で数値誤差の扱いに注意を要する。二つ目は表現の選択が示すモデルの一般化能力であり、PIKANの表現がすべてのケースで万能ではない点である。三つ目は最適化器のスケーラビリティであり、大規模モデルに対して従来の最適化戦略がそのまま通用するかは未解決である。加えて、実務での課題としてはセンサ配置や観測頻度の制約、計算リソースの確保、そして結果をどう解釈して業務判断につなげるかといった運用面の問題が残る。これらは次の実証プロジェクトで重点的に評価すべきである。

6.今後の調査・学習の方向性

今後は三方向の展開が有望である。一つは表現と最適化の共同設計であり、問題の性質に応じて自動的に最適な表現と学習スケジュールを選ぶメタ学習的アプローチの開発である。二つ目は数値的頑健性の確保であり、単精度(single)と倍精度(double)のトレードオフを明確に評価した上で、実務に適した基準を作ることが重要である。三つ目は産業応用に向けた簡易プロトコル作成であり、小規模の灰色箱課題でROIを評価し、段階的に本番領域へ拡張する実装指針を整備することが望まれる。検索に使える英語キーワードは、”Physics-Informed Neural Networks”, “PIKANs”, “Kolmogorov–Arnold Networks”, “systems pharmacology”, “pharmacokinetics”である。

会議で使えるフレーズ集

『部分的に分かっている物理則とデータを組み合わせて、見えない状態やパラメータを推定する手法です』、『まずは小さな灰色箱課題でプロトタイプを作り、学習速度と精度、コストのトレードオフを評価しましょう』、『表現(モデルの作り)と最適化(学ばせ方)の組合せが結果を大きく左右します。どちらも評価が必要です』。これらを用いれば短時間で要点を伝えられるはずである。


引用元: N. A. Daryakenaria, K. Shukla, G. E. Karniadakis, “Representation Meets Optimization: Training PINNs and PIKANs for Gray-Box Discovery in Systems Pharmacology,” arXiv preprint arXiv:2504.07379v1, 2025.

監修者

阪上雅昭(SAKAGAMI Masa-aki)
京都大学 人間・環境学研究科 名誉教授

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